众所周知，传统珠算在运算时，由于脑、眼、口、耳、手等器官和肢体的协同动作，本身就具有较强的启智功能。而珠心算在开发大脑功能上更有其独特的作用，主要表现在两个方面：

其一是双手拨珠活动，促进了大脑整体功能的开发。双手拨珠是近年来我国珠算技术的新发展，是珠心算教育中的必经动作。通过左右双手共同拨珠，使人的视觉、听觉、触觉及整个肌肉都协调一致的活动，大脑左右两半球同时运用、共同指挥手的操作，右手的运动开发了左脑的计算和逻辑功能，左手的运动开发了右脑的想象力和创造力功能，左右两半球互传信息，协调了双手的动作，也开发了大脑的整体功能。

其二是“脑像图”的动作，进一步开发了大脑潜能。珠心算教育进入高级阶段后，大脑中形成“脑像图”，可以完全不用手指拨珠，而是直接在大脑中展开运算。“脑像图”的动作主要是依靠右脑活动进行的，这种人脑中的直接运算操作，有力地促进了右脑功能的开发，从而促进了大脑整体功能的提高。